1958年12月，医院更名为山东省烟台专区莱阳精神病防治院，隶属于烟台专署卫生局。

 1968年3月，医院更名为莱阳精神病医院，隶属于烟台专署卫生局。

 1977年9月，医院更名为山东省烟台地区精神病防治院，隶属于烟台地区卫生局。

 1983年10月，医院更名为烟台市莱阳精神病防治院，隶属于烟台市卫生局。

 1995年12月，医院更名为烟台市心理康复医院，隶属于烟台市卫生局。

 2009年4月，经山东省卫生厅批准，医院启用第二名称----烟台市精神卫生中心。

 2014年5月，医院与北京大学第六医院(北京大学精神卫生研究所)建立合作关系，开展科研、医疗、教学等方面的全方位合作。

 2014年10月，医院成为烟台市精神病学住院医师规范化培训基地。

 2014年12月，医院成立烟台市精神病学质量控制中心。

 2015年3月，医院精神科被评为山东省临床医学重点专科。

 2015年3月，医院与鲁东大学合作，建立起应用心理学研究生实践基地。

 2015年，医院成为国家精神心理疾病临床医学研究中心网络成员单位。

 2015年，是医院标准化建设年，医院高标准、严要求，全面做好三级医院评审准备工作;同时围绕评审主题，持续改进工作。经过全院干部职工的共同努力，同年12月，医院顺利通过三级甲等专科医院现场评价。

 2016年3月，医院正式被山东省卫生和计划生育委员会命名为“三级甲等精神病专科医院”。

 2017年5月，医院与北京大学第六医院签署第二期合作协议。

 2017年11月11日，经烟台市民政局、烟台市卫生计生委批准，由医院组织筹建的烟台市心理卫生协会正式成立。